事业编制的单位也会面临机构改革、机构精简和人员精简的问题。
在事业单位机构改革的过程中，不会出现政策性裁员，但会出现体制性减员。
也就是说，在事业单位正式编制体系之内的工作人员，不会因为机构改革而丢掉饭碗，但会出现转制、转岗的情况。对于那些虽然在事业编制的单位工作却不在体制内正式编制序列的合同制的以及临时性的工作人员，则依然会出现终止劳动合同和解除雇佣关系的情况。
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