事业单位账户注销时，按照国家事业单位会计核算的相关要求，将事业单位账目中，所有的收入、支出都结转到事业结余中，往来账款按照规定，能清理的要全部清理完毕，要不回来的多年坏账，按照坏账的相关报批手续，进行坏账处理并进行结转，最后按照上级部门的相关规定，在账账相符、账实相符的条件下，将余额部门上交上级相关部门，进行事业单位账户注销。
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