通过测量分子粒径大小到区分。小分子物质粒径：小于1nm（常见溶液，氨基酸，CO2等）；大分子物质粒径：1－100nm（蛋白，核酸，常见胶体等）。所谓粒径，就是颗粒的直径、大小或尺寸。
相关介绍：
大分子与小分子
大分子
大分子指相对分子质量在5000以上，甚至超过百万的生物学物质，似蛋白质、核酸、多糖等。它与生命活动关系极为密切，由被认为单体的简陋分子单位所组成。在溶液中有形成凝胶的物质。一样把相对分子质量超过一万的化合物称为大分子化合物或高分子化合物。它是由许多复重的结构单元组成，一样具有线状结构，有的'具有枝状结构。许多具有复要生物作用的物质，似蛋白质和核酸等均属于这类化合物。大分子蛋白质的基本组成单位或构件分子（building-block molecule）是氨基酸（amino acid，AA）。
小分子
小分子，即OCO小分子。从化学的角度上说，小分子就是分子量很小的天然化合物，通常是指分
子量小于1000道尔顿（特别小于400道尔顿小分子）的生物功能分子；从生物角度上说，小分子就是具有生物活性的小肽、寡肽、寡糖、寡核苷酸、维生素、矿物质、小分子团水、植物次生代谢产物及其降解产物似苷元、黄胴元、甙元、生物碱等；从营养角度上说，假设把蛋白质、脂肪、糖、维生素、矿物质、纤维素，称为“首先代营养素”，小分子是营养元素的“第二代”，简称之为“二代营养素”。
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