简单的说，是储存着化学能的。
高中生物讲的“还原氢”，[H]，是NADH、FADH2的“简写”。它们分别是NAD与FAD的还原型。
有氧呼吸的第三阶段，即 电子传递链（是一些列化学反应的反应“链”）。这两种物质在电子传递链开始时发生氧化反应，其上的H被氧化，其中的化学能也就传递到了反应链中。最终经过电子传递链的一系列反应后生成了水，过程中伴随ATP生成。
不过我觉得高中阶段讲的不明不白的，会有几个对这个过程的误读。首先，这个过程要经过多步反应，而不是刚开始那个“氢”直接就和氧反应生成水去了。
其次，生成ATP也并不是因为最后的反应生成水，最后生成水只是 氢和其上的电子的“最终去处”，可用的能量已经在电子传递链过程中被“榨干”了。
最后，生成ATP是因为电子传递链过程中，在线粒体内膜两侧形成了“质子梯度”（质子被单方向运出线粒体内膜而造成）。这种质子的浓度梯度就包含了合成ATP的动力。合成ATP是由ATP合酶催化的，质子通过ATP合酶（就像水流推动涡轮）重新穿过线粒体内膜进去线粒体基质消除了电动势，这部分能量就用于产生了ATP（就像水流推动涡轮，产生动能发电）。
最后总结一下。“还原氢”蕴含着有化学能的（即NADH,FADH2蕴含化学能）。但是并不是因为氢氧反应生成水放能而是因为过程中的一系列步骤。
感兴趣可以搜一下“电子传递链”，“氧化磷酸化”。
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