新疆大学有总部、南校区和北校区三个校区，总占地面积290.9万平方米（约4363亩）。新疆大学总部位于乌鲁木齐市天山区胜利路666号；新疆大学南校区位于乌鲁木齐市天山区延安路1230号；新疆大学北校区位于乌鲁木齐市沙依巴克区西北路449号。
目前，学校拥有经济学、法学、文学、历史学、理学、工学、管理学、艺术学、哲学等9个学科门类，涵盖高级专业培养和科研的主要领域。现有2个国家重点学科（中国少数民族语言文学、应用数学）、1个国家重点培养学科（人口、资源与环境经济学）、3个双一流重点建设学科（马克思主义理论、化学、计算机科学与技术）、6个自治区重点学科高峰学科、7个自治区高原学科、3个学科（化学与工程）在第四轮国家学科评估中，7个学科进入乙类学科，9个学科进入丙类学科。有博士学位授权一级学科14个，硕士学位授权一级学科34个，流动博士后科研工作站12个，专业硕士学位类别18个。是新疆中学授权名额最多、学位授权体系最完整的大学。目前，该校本科专业95个，其中招生专业69个，国家一级本科专业建设点29个，省级一级本科专业建设点9个，国家特色专业10个，自治区人才紧缺专业18个，自治区重点专业12个。
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