主管药师考试共有4个科目。主管药师考试科目具体为：《基础知识》、《相关专业知识》、《专业知识》及《专业实践能力》。
主管药师考试科目及考试形式全国统一，每个科目的题量为100题，全部均为选择题。选择题具体分为A1型、A2型、A3型、A4型、B1型五种。A1型题（单句型最佳选择题）；A2型题（病例摘要型最佳选择题）；A3型题（病例组型最佳选择题）；A4型题（病例串型最佳选择题）；B1型题（标准配伍题）。
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