财务专项监督具有制约性和促进性两大作用。通过对公共组织财务活动的专项监督审查，对该单位的财务收支及经营管理活动进行监督和鉴证，可有效制约贪污舞弊、弄虚作假、严重损失浪费及无效率的行为，并依法追究有关责任人的责任，提请行政处分或刑事处罚，保证党和国家法律、法规、方针、政策、计划及预算的贯彻执行，维护财经纪律和各项规章制度。
此外，财务专项监督通过揭示差错和弊端，不仅可以纠正核算差错，提高财务工作质量，还可以保护财产安全和完整，防止国有资产流失和非正常损失，有效防止资金使用中的铺张浪费，堵塞漏洞，促进勤俭节约，充分发挥资金的效益，维护国家利益。
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