出口收汇核销单因故遗失，需向主管外汇管理局申请补办的，可向主管税务机关退税部门申请出具《补办出口收汇核销单证明》，据此向外汇管理局申请补办出口收汇核销单。
2012年，国家外汇管理局、海关总署和国家税务总局联合颁布《关于货物贸易外汇管理制度改革的公告》（国家外汇管理局公告2012年第1号），决定自2012年8月1日起报关出口的货物，企业申报出口退税时不再提供出口收汇核销单。税务部门参考外汇局提供的企业出口收汇信息和分类情况，依据相关规定，审核企业出口退税。
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