企业并购审计存在的问题包括：
1、相关的法律法规不健全：我国现已颁布实施的法律法规，从不同的角度对企业并购活动进行了规范，但是仍存在不健全的地方，主要表现在相关的会计准则规范和审计准则规范不完善。
2、资产价值评估不规范：包括资产评估市场不完善，资产评估范围不明确，资产价值难以准确确定。
3、缺乏具有专业技能的高素质审计人员，导致审计质量不高：审计质量是指审计工作过程极其结果的优劣程度。审计质量包括审计结果的质量和审计行为过程的质量。
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