同步审计的目的在于及时查出计划执行过程中出现的偏差，找出产生偏差的原因，不失时机地提出改进意见和建议，以供企业决策者参考，有效地保证企业计划的顺利实施。
通过同步审计，可以发现财政工作深层次方面的问题，对于宏观调控和领导决策更具参考价值，还可以使下级审计机关根据上级的统一要求实施审计方案，帮助下级审计机关提高财政审计业务水平。同步审计也有利于扩大审计影响，通过上下配合、协同审计，产生审计震慑作用，减少行政干扰行为。
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