应付票据审计的目标在于确定应付票据的发生及偿还记录是否完整、确定应付票据的年末余额是否正确以及确定应付票据在会计报表上的披露是否充分。应付票据审计是审计机关对被审计单位开具或承兑的在短期内完成兑付的各种票据所开展的审查监督活动，其中主要包括对银行承兑汇票的审计和商业承兑汇票的审计。
通过有序开展应付票据审计工作，可以一定程度上确保被审计单位票据信息的真实性和可靠性，同时促进了被审计单位票据管理体系的完善。
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