里昂第一大学共设有5个教学研究单位(faculté),3个学院(Institut),5个学校(école)以及一个独立的系,分别为:里昂东部医学院;里昂南部梅里约医学院;牙科学院;科学与技术学院;体育科学与技术学院(UFR STAPS);医药学及生物学院(ISPB);复建科学与技术学院(ISTR);里昂一大大学技术学院;里昂一大大学理工学校;金融学及保险学校;里昂科学院硕士培养学校(IUFM);里昂天文台;化学、物理、电子高等学院;人体生物学系(BH)
具体专业包括材料与结构科学、生物学与自然科学、数学在社会科学中的应用、机械学、物理学、电子学、电子工程与自动化、物理化学、化学、生物化学、有机生物学与人口、细胞生物学、生物工程学、生理学、地球科学、离散数学以及医学药学、康复、牙科学、材料科学、环境科学、医学、临床医学等。