IARU (International Alliance of Research Universities)，国际研究型大学联盟，由全球十所顶尖研究型高校组成，除哥本哈根大学外，其他九所成员学校包括：北京大学，东京大学，剑桥大学，牛津大学，耶鲁大学，加州大学伯克利分校，苏黎世联邦理工学院，澳大利亚国立大学，新加坡国立大学。
2006年，哥本哈根大学牵头，联合北京大学及其他IARU成员，成立了“Aging, Longevity and Health”（衰老，长寿与健康）项目，旨在通过多领域、全方位的合作，探究21世纪亟待解决的衰老机理及人类生命机制问题：小到分子、DNA、大脑，大至日常行为、社会关系、文化特质。
同时，哥本哈根大学积极参与IARU GSP (Global Summer Program)，开办富有特色的各类课程，同时遴选最优秀的学生参加仅限成员学校的暑期特别课程，并提供奖学金，使学生通过与各地各校的顶尖学子和学者交流，具有跨学科、跨文化的全球视野，迎接21世纪的各类重大挑战。
丹麦王国是唯一一个与中国有着百年不间断外交关系的国家，也是率先同中国建立全面战略伙伴关系的北欧国家。基于斯堪的纳维亚地区深厚的汉学研究底蕴，哥本哈根大学组织了多项有关中国的研究，也开展了许多与中国方面的合作。
哥本哈根大学与中国的现当代交流始于1937年尼尔斯·玻尔对中国的访问，以及随后的周培源、张宗燧、胡宁等科学家前往彼时的哥本哈根理论物理研究所的造访。20世纪60年代，奥格·玻尔承父遗志，冲破国际意识形态的樊篱，邀请中国学者赴玻尔所进行学术交流，充分践行了哥本哈根精神，并开启了中丹友好学术访问之先河。这其中还穿插着李政道和杨振宁与两代玻尔的友谊。
2012年，哥本哈根大学制定了面向中国的战略政策，并配有具体的行动计划，旨在充分利用和发挥已有的以及即将建立的相关中国研究机构的作用 。该行动计划包括定位哥本哈根大学所有与中国相关的活动，支持中丹教育研究课题，与哥本哈根商学院合作发展丹麦与中国问题的智库ThinkChina.dk。以上各项工作由哥本哈根大学跨学科机构“活力亚洲倡议”协调开展。
人文学院下的“中国研究”部门和北京大学及浙江大学建立了稳定的合作关系，每年约有40名哥本哈根大学学生在该合作框架下赴北大和浙大学习。2010年11月，武汉大学信息管理学院与皇家图书情报学院签署合作协议 。2013年，“复旦—欧洲中国研究中心” 在哥本哈根大学成立，是复旦大学在欧洲第一个（也是继2012年成立的“复旦大学-加州大学当代中国研究中心”之后海外第二个）建立的中国研究中心，旨在促进多项在欧洲地区的前沿性且富有政策涵义的中国研究，深化中欧学术伙伴关系 。
自然科学院和医学院下均设有专项中丹研究基金中心，比如，丹中分子纳米电子学中心、中丹乳腺癌研究中心、医学基因组学灵北 (Lundbeck) 基金中心。华大基因将其欧洲总部建立在哥本哈根生物科技园也是工业合作的成功案例之一。哥本哈根大学同时也是中国科学院大学中丹学院的丹方主导学校和积极合作伙伴。中丹中心设在北京，与中国科学院大学合办，其工作内容包括多个学科领域的教育研究活动，如水资源和环境、纳米科学、可持续能源、生命科学和社会科学。
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