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深圳大学于2008年12月获教育部批准，开设临床医学专业，同年成立深圳大学医学院。
深圳大学医学院确立了“高端、精英、超前、精湛”的办学理念。中国工程院钟南山院士为医学院名誉院长。
2013年4月，为进一步整合学科资源，优化学科布局，推动深圳大学医学学科的快速发展，学校组建了深圳大学医学部。学部下设基础医学院、生物医学工程学院、护理学院、药学系、预防医学系、深圳大学医学中心、医学人文中心、深圳大学校医院、附属医院等部门。国家基金委创新群体首席科学家，国家杰出青年获得者，基金委重大及重点项目负责人，多项国家863，973计划负责人朱卫国教授担任医学部主任，兼任医学院院长;医学院党委书记谢苗兼任医学部副主任。
深圳大学医学部现有师资中约61%的教师具有海外留学或工作经历。其中有美国国家科学院、工程院、医学科学院、发明家科学院四院院士，美国国家科学院、工程院医学科学院、瑞典科学院三院院士、诺贝尔生理及医学奖评委会主席， 国家“顶尖千人”、“千人计划”特聘专家，国家首席科学家，国家杰出青年、国家百千万人才工程专家，国务院政府特殊津贴获得者，特聘教授，鹏城学者，全国高等学校临床医学专业评审委员会委员，教育部生物医学工程类专业教学指导委员会委员，教育部公共卫生专业教学指导委员会委员，国家自然科学基金专家评审组成员，外籍教师等。
医学部在深圳大学后海校区起步，医学部新校区正在西丽大学城建设。教学、科研建筑面积达7.7万平方米，将于2017年3月投入使用。深圳大学附属医院位于西丽校区附近，它将建设成为与国际接轨的集医疗、教学、科研、康复和预防保健等为一体的三级甲等具有专科特色的综合型高端教学医院，2017年初交付使用并试营业。
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