应用本科和自考本科的区别主要体现在教育层次，人才培养方向，学习方式等方面，应用本科和自考是我国两种不同的教育形式，应用本科是高职教育的一个层次，自考本科是成人教育形式。
应用本科培养的是适应生产、建设、管理、服务第一线需要的高等技术应用性人才，培养过程更突出专业技术应用能力、创新能力和实践技能的训练，毕业生经考核可获得毕业证、学位证和相关专业的职业资格证。应用本科是本科教育的一种类型，招生计划用的是普通本科计划，学生享受普通本科待遇。
自考本科是高等教育自学考试本科的简称，自考本科是我国基本高等教育制度之一，成绩合格后由主考学校和高等教育自学考试委员会联合颁发大学毕业证书，参加自考的考生不受性别、年龄、民族、种族和已受教育程度的限制，不用经过入学考试，即可根据自己的情况选择相关的专业，考试科目全部成绩合格，即可申请毕业。
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