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药学
药学专业是国家“双高”专业群的核心专业重庆医药专科学校排名，是国家骨干专业、全国职业院校健康服务类药学专业首批示范点重庆医药专科学校排名，是省级优质校建设专业和骨干专业。第一牵头建成了国家级药学专业教学资源库重庆医药专科学校排名，建有国家精品在线课程3门、省级精品在线课程和一流课程17门。拥有国家级生产性实训基地2个重庆医药专科学校排名，省级工程研究中心和重点实验室4个重庆医药专科学校排名，省级重点学科2个。是首批全国职业院校教师教学创新团队、全国巾帼文明岗、省级高校黄大年式教师团队和2个省级教学团队，荣获国家教学成果二等奖和省级教学成果一等奖。“金平果”2020-2021年高职专业群及专业排行榜，药学类专业连续2年保持全国第一。
临床医学
临床医学专业是国控医师类专业，拥有72年办学历史，专业综合实力和办学水平在全国同类院校中名列前茅。临床医学专业是全国唯一一所定点为武警、陆军培养军事卫生士官的专业，是教育部首批“3+2 卓越医生教育培养计划”试点专业，重庆市级优质校和示范校建设重点专业，重庆市级骨干专业。专业团队在全国率先开展器官系统整合课程教学改革。临床医学专业拥有国家首批课程思政教学团队和课程思政示范课程、国家精品在线开放课程、重庆市级重点学科。专业开设了医学美容方向、医学影像方向、健康大数据与云计算应用方向辅修班，为医疗卫生行业和大健康产业培养高素质技术技能复合型医学人才。学生毕业即可报考普通本科院校“专升本”和“3-+2”助理全科医生规范化培训项目，毕业一年可报考执业(助理)医师资格考试，考取执业（助理）医师资格两年后，可报考执业医师资格考试。
护理
护理专业是首批国家“双高计划”建设专业、国家级骨干专业，首批全国职业院校养老服务类示范专业点。全国护理专业教学资源库主持单位，国家护理专业教学标准制定单位，教育部首批“1+X”老年照护证书考培基地。与北京协和医院、四川大学华西医院、重庆市人民医院等72家医院及健康产业机构深度合作，建立了优质稳定的校外实践教学基地。70余年“校院融合，人才共育”的人才培养模式为社会培养了大量就业竞争力和岗位胜任力强的“德技双馨”的护理人才。学生在各级各类创新创业类及技能大赛中获得一等奖5项。近200名毕业生成为援鄂“抗疫英雄”，深受所在单位的高度赞扬及好评。
医学检验技术
医学检验技术专业办学历史悠久，为省部级示范专业、骨干专业、资源库建设专业、双基地建设专业，是学校市级优质校和双高建设中的创一流品牌专业。团队获省部级优秀教学团队称号，是高职高专医学检验技术专业骨干教师国家级培训基地。所在单位是全国高等院校医学检验专业校际协作理事会常务理事单位。专业有6000平方米校内教学实训场地，1000余万现代检验仪器设备，拥有自主知识产权的虚拟医学检验实训软件和仿真医院检验科实训基地。专业人才培养质量高，在校生连续多年在省部级双创竞赛中获奖，毕业生就业面广，就业率高达98.5%。
中医学
中医学专业是国家教育部现代学徒制试点专业，重庆市教委专业能力提升项目建设专业，重庆市优质校建设专业。拥有近50年的办学历史，办学条件好，师资力量雄厚。为适应新形势下医疗卫生事业的发展，学校于2015年始联合市内6家三甲中医院，开展了融中医传统“师承教育”和“院校教育”于一体的中医现代“学徒制”人才培养模式改革，该培养模式已被重庆日报、人民网、中国高职高专网等主流媒体多次报道，入选了橙子主编的《杏林守望》报告文学集。
智慧医疗装备技术
智慧医疗装备技术专业实施“创新引领、服务区域、产教融合”的人才培养模式，培养医学与工程思维兼具，电子和信息应用技能一体，具有良好的人文素质，具有“学科交叉融合”特征的新工科人才。该专业以岗位需求为目标，以就业市场为导向，毕业生主要从事智慧医疗装备的应用维护、生产调试和资产管理等工作，学生就业率达100%，2021年专升本上线率达84%。
2019年经市教委批准开始与重庆科技学院共同实施专本贯通分段培养智能产业高端技术技能型人才试点项目，共同培养医工融合高端技术技能人才（春季分类招生）。
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